Compete à Divisão da Cooperação Inter-Regional promover a divulgação de oportunidades e o fomento da cooperação transfronteiriça, transnacional e inter-regional (nacional e internacional), bem como coordenar o apoio técnico às iniciativas de cooperação com interesse para os actores e agentes locais e assegurar a participação regional em instâncias europeias de cooperação transfronteiriça, transnacional e inter-regional, bem como a representação nos órgãos de gestão e acompanhamento de programas com incidência regional, orientadas, naturalmente, para o desenvolvimento sócio-económico do Alentejo e das demais regiões participantes.

VERTENTES DA ACTIVIDADE

A Actividade da Divisão da Cooperação Inter-Regional desenvolve-se nas seguintes vertentes:

Cooperação Territorial Europeia, a cooperação territorial europeia apoia intervenções conjuntas dos Estados-Membros em acções de desenvolvimento territorial integrado, nas três vertentes de cooperação consagradas pela Iniciativa Comunitária INTERREG.

O Alentejo  participa nos espaços de cooperação seguintes: 

Cooperação Transfronteiriça Portugal Espanha, que engloba o conjunto de actividades decorrentes dos protocolos de cooperação celebrados entre a CCR Alentejo e a Junta de Extremadura em Janeiro de 1992 e entre a CCR Alentejo e a Junta de Andalucia em Janeiro de 2001;

Cooperação Transnacional e Interregional, fundamentalmente concretizada na participação da região em projectos que se desenvolvem nos domínios do Espaço Atlântico, do Sudoeste Europeu e do Mediterrâneo Ocidental;

Associações Europeias, na qual se integra todo o conjunto de actividades de dinamização, promoção e cooperação de âmbito internacional entre o Alentejo, regiões no território da UE e países vizinhos( alargamento) no sentido de aumentar a coesão e o desenvolvimento regional.